Көп жасушалы организмдерде әр түрлі мүшелер мен ұлпалардың мамандандырылған жасушалары арасында құрылымдық айырмашылықтар болады. Әр түрлі ұлпаларды құрайтын жасушалардың пішіндері сол ұлпаның белгілі бір функцияларын орындауға бейімделген. Мысалы, жануар тіндерінің түрлеріне жүйке тіні, эпителий ұлпасы, дәнекер тін және бұлшықет тіні жатады. Эпителий ұлпасындағы жасушаларда жасушалардың өткізбейтін қабат түзуіне мүмкіндік беретін тығыз байланыс деп аталатын байланыстары бар. Керісінше, жүйке жасушаларында дендриттер мен аксондар деп аталатын проекциялар бар, олар жасушалардың тор ретінде өзара әрекеттесуіне және жүйке импульстарын өткізуіне мүмкіндік береді.
Жануарлар мен өсімдіктер әлемінің жасушаларының негізгі айырмашылығы олардың қоректену тәсілінде. Өсімдік жасушалары — автотрофтар, яғни олар органикалық заттарды бейорганикалық заттардан синтездейді, олар фотосинтез процесінде күн сәулесінің энергиясына байланысты. Жануарлардың жасушалары — гетеротрофтар, яғни тамақпен қамтамасыз етілген органикалық заттар олар үшін көміртегі көзі қызметін атқарады; дәл осы заттар энергия көзі ретінде де қызмет етеді. Барлық эукариоттық жасушалар ортақ сипаттамаларға ие, сонымен қатар олардың жасушалық құрылымында айырмашылықтар бар.
Фотосинтезді қамтамасыз ету үшін өсімдік жасушаларында пластидтер бар, мысалы, фотосинтездің негізгі пигменті — хлорофилл болатын хлоропласттар. Жануарлар клеткаларында пластидтер жоқ, дегенмен, ерекше эволюция бар, мысалы, жасыл эвглена кіретін өсімдік флагеляты. Қараңғыда ол дайын органикалық заттармен қоректенеді (жануар сияқты), ал жарықта ол фотосинтездеуге қабілетті. Өсімдіктер мен жануарлар көп клеткалы организмдер, ал саңырауқұлақтар (көптік, саңырауқұлақтар) не бір клеткалы, не көп клеткалы болуы мүмкін. Жануарлар жасушаларында жасуша қабырғалары болмайды. Өсімдіктер мен кейбір саңырауқұлақтарда жасуша қабырғалары бар, бірақ олар әртүрлі полисахаридтерден (көмірсулар молекулаларының тізбектері) тұрады. Өсімдіктердің жасушалық қабырғалары целлюлозадан, ал саңырауқұлақтар — хитиннен жасалған. Тек өсімдік жасушаларында фотосинтез жасайтын органеллалар — хлоропластар болады. Өсімдіктер мен саңырауқұлақтар жасушаларының вакуольдеріне, мембранамен байланысқан қоймаларына тургор қысымын ұстап тұру үшін пайдаланылатын үлкен орталық вакуоль, жасуша пішінін сақтауға көмектесетін сыртқа итергіш күш жатады.